Der Film In aller Freundschaft dreht sich um die bewegende und herausfordernde Geschichte von Ärzten, Patienten und ihren Beziehungen in einem großen Krankenhaus. In einer angespannten Situation muss ein Patient mit unerträglichen Schmerzen und schwierigen Entscheidungen bezüglich seiner Gesundheit umgehen. Er bittet um eine stärkere Schmerzmedikation, doch der Arzt rät ihm, gut zu überlegen, bevor er sich für eine weitere Behandlung entscheidet.
Ein wichtiger Teil des Films dreht sich um die Spannungen im Krankenhaus, insbesondere um die Veränderungen in der Führungsebene. Ein heftiger Streit zwischen den Ärzten entbrennt über die Art und Weise, wie das Krankenhaus geführt werden soll. Die Spannung wächst, als ein Arzt das Krankenhaus in eine wirtschaftlichere Richtung lenken möchte, um die Effizienz und den Gewinn zu steigern. Allerdings stimmt ein Teil der Ärzte, wie Dr. Hemann, diesem Plan nicht zu und ist der Meinung, dass dies die Werte des Krankenhauses gefährden würde, indem es eher den persönlichen Gewinn als die Patientenversorgung in den Mittelpunkt stellt.Als der Streit über die zukünftige Ausrichtung des Krankenhauses eskaliert, findet eine wichtige Operation statt. Ein Patient wartet auf eine Herztransplantation, doch der Chirurg stellt fest, dass das angebotene Herz nicht gesund genug ist. Dies zwingt den Patienten, sich mit einer lebenswichtigen Entscheidung auseinanderzusetzen: Mit einem künstlichen Herzen weiterleben, bis ein neues Herz zur Verfügung steht, oder die bittere Realität der eigenen Gesundheit akzeptieren.
Zur gleichen Zeit werden auch die persönlichen Geheimnisse der Ärzte immer mehr enthüllt. Einer von ihnen steht vor schweren persönlichen Krisen und familiären Konflikten, was ihn in eine verzweifelte Lage versetzt. Doch letztlich helfen ihm diese Herausforderungen, den wahren Wert des Lebens, der Freundschaft und des Opfers zu erkennen. Währenddessen wird die Führung von Dr. Marwart immer stärker, als sie die Position der Ärztlichen Direktorin des Krankenhauses übernimmt. Sie muss nicht nur berufliche Herausforderungen bewältigen, sondern auch mit angespannten Beziehungen und Widerstand von Kollegen umgehen. Die Veränderungen, die sie vorschlägt, stoßen nicht überall auf Zustimmung, doch sie ist entschlossen, eine neue Vision für das Krankenhaus zu bewahren, auch wenn sie vielen Schwierigkeiten und Widerständen ausgesetzt ist.
Alles eskaliert, als eine wichtige Entscheidung getroffen wird: Kann das Krankenhaus unter der neuen Führung bestehen, oder wird es mit einer Krise konfrontiert, die nicht überwunden werden kann? Die Antwort darauf könnte alles verändern, was das Krankenhaus über Jahre hinweg aufgebaut hat. Der Film ist eine emotionale Reise über das Konfrontieren von Krankheit, Opfer und schwierige Lebensentscheidungen, während er gleichzeitig interne Probleme einer medizinischen Einrichtung widerspiegelt. Jeder Charakter, sei es ein Arzt oder ein Patient, muss den Sinn des Lebens finden und sich der harten Wahrheit des Schicksals stellen.